שבוע 3 — מעבדה מעשית
בסוף השיעור תדעו:
1. Open FIJI
2. Drag image file into FIJI window
(or File → Open → select file)
3. Image opens in a new windowחשוב
לפני שסמים ציוני דרך — יש לכייל את קנה המידה!
1. Select "Straight Line" tool (press L)
2. Draw line along the scale bar in image
3. Analyze → Set Scale
4. Enter known distance (e.g. 10 mm)
5. Check "Global" → OKכעת כל מדידה תוצג ב-mm (או ביחידות שבחרתם).
1. Select "Multi-Point" tool (press the dot icon)
2. Click on each landmark in order (1, 2, 3...)
3. Right-click to remove last point
4. Analyze → Measure (Ctrl+M) to see coordinates
5. File → Save As → Results (saves as .csv)אזהרה
סדר הציוני דרך חייב להיות זהה על כל הפרטים בדגימה!
hadrian_[שם_משתמש].csvעצה
בצעו את הדיגיטציה פעמיים ללא הסתכלות על הניסיון הראשון — נשווה בין השניים כדי למדוד שגיאת מדידה.
import numpy as np
# שתי דיגיטציות של אותו מטבע
attempt1 = np.array([[142, 891], [378, 734], [521, 612]])
attempt2 = np.array([[145, 889], [381, 731], [519, 615]])
# שגיאת שורש-ממוצע-ריבועים (RMS)
diffs = attempt1 - attempt2
rms = np.sqrt(np.mean(diffs**2))
print(f"שגיאת מדידה (RMS): {rms:.2f} פיקסלים")שגיאת מדידה < 2% מהשונות הכוללת = מקובל.
צורה בזמן — שי גורדין, אוניברסיטת אריאל