משאבים

כלים, קריאות, מאגרי נתונים וקישורים שימושיים

כלים חיוניים

כלים לכל מפגש (מבוססי דפדפן)

כלי	מה הוא עושה	קישור
Google Colab	הרצת קוד Python בדפדפן	colab.research.google.com
Claude	AI ליצירת קוד והסבר	claude.ai
ChatGPT	AI חלופי לקוד	chat.openai.com
Google Drive	שמירת נתונים ומחברות	drive.google.com

הורדה חד-פעמית (שבוע 3 בלבד)

כלי	מה הוא עושה	קישור
FIJI / ImageJ	דיגיטיזציה של ציוני דרך מתמונות	fiji.sc

חבילות Python

כולן מותקנות ב-Colab עם !pip install:

חבילה	מטרה	תיעוד
`morphops`	יישור פרוקרוסטס, splinesלוחות דקים	github.com/tpgillam/morphops
`pyefd`	מתארים פורייה אליפטיים	github.com/hbldh/pyefd
`scikit-learn`	PCA וכלי ML אחרים	scikit-learn.org
`scikit-image`	עיבוד תמונה (חילוץ קו מתאר)	scikit-image.org
`matplotlib`	ציור גרפים	matplotlib.org
`seaborn`	ויזואליזציה סטטיסטית	seaborn.pydata.org
`numpy`	מערכים מספריים	numpy.org
`pandas`	טבלאות נתונים	pandas.pydata.org
`statsmodels`	בדיקות סטטיסטיות	statsmodels.org

קריאות

טקסטים יסודיים (מסופקים כקטעים)

Kendall, D.G. (1977). The diffusion of shape. Advances in Applied Probability 9:428–430.
Bookstein, F.L. (1991). Morphometric Tools for Landmark Data, Chapter 2. Cambridge University Press.
Slice, D.E. (2007). Geometric morphometrics. Annual Review of Anthropology 36:261–281.
Zelditch, M.L. et al. (2012). Geometric Morphometrics for Biologists (2nd ed.), Chapter 1. Academic Press.

יישומים ארכאולוגיים מרכזיים

Karasik, A. & Smilansky, U. (2011). Computerized morphological analysis of pottery. Journal of Archaeological Science 38(10):2644–2657.
Wilczek, J. et al. (2014). Morphometrics of Second Iron Age ceramics — strengths, weaknesses, and comparison with traditional typology. Journal of Archaeological Science 50:39–50. [מאגר נתוני כלי החרס של הקורס]
Monna, F. et al. (2013). Morphometry of Middle Bronze Age palstaves. Journal of Archaeological Science 40:507–516. [רקע למאגר נתוני הגרזנים של הקורס]
Wilczek, J. et al. (2015). Unsupervised model-based clustering for typological classification of Middle Bronze Age flanged axes. Journal of Archaeological Science: Reports 2:523–532. [מאגר נתוני הגרזנים של הקורס]
Bonhomme, V. et al. (2014). Momocs: Outline analysis using R. Journal of Statistical Software 56(13):1–24.
Selden, R.Z. (2018). Ceramic morphological organisation in the Southern Caddo Area. Journal of Cultural Heritage 32:215–223.

על AI במחקר ובכתיבה

דף הקורס: “כיצד להשתמש ב-AI לניתוח נתונים” (מסופק בשבוע 4)

משאבי נתונים פתוחים

מאגר	הכי מתאים ל	קישור
Zenodo	מאגרי נתונים מפורסמים עם DOI	zenodo.org
OSF	רישומים מוקדמים ונתוני שחזור	osf.io
Figshare	נתוני נספח מכתבי-עת	figshare.com
MorphoSource	סריקות תלת-ממד של פרטים ביולוגיים וארכאולוגיים	morphosource.org
tDAR	ארכיון נתונים ארכאולוגי ספציפי	tdar.org
ADS (בריטניה)	נתוני ארכאולוגיה בריטית	archaeologydataservice.ac.uk

טיפ לחיפוש מאגרי נתוני GM: > ב-Zenodo: חפשו "tps file" archaeology או "geometric morphometrics" landmarks archaeology

מאגרי מוזיאונים למטלה 1

אוסף	כיסוי	קישור
British Museum	עולמי, מצוין למטבעות	britishmuseum.org/collection
Metropolitan Museum	עולמי, חזק במזרח הקרוב	metmuseum.org/art/collection
Europeana	אוספים אירופאיים מאוחדים	europeana.eu
ARACHNE	מאגר ארכאולוגי גרמני	arachne.uni-koeln.de
American Numismatic Society	מטבעות	numismatics.org
Finds.org.uk	חפצי מתכת של רומן בריטניה	finds.org.uk

כיצד לכתוב פרומפטי AI טובים (מהדורה מהירה)

השתמשו במסגרת PEAR:

P — Purpose: "אני רוצה להשוות שתי קבוצות של צורות מטבע..."
E — Example: "הנתונים שלי נראים כך: [הדביקו 5 שורות ראשונות או צורת מערך]"
A — Action: "כתבו קוד Python ש..."
R — Result: "...ויפיק גרף פיזור מסומן עם מקרא"

איטרציה היא נורמלית. הקוד שנוצר ראשית על ידי AI עשוי לדרוש ניפוי באגים. הדביקו את הודעת השגיאה חזרה ל-AI ובקשו ממנו לתקן את הבעיה.

אם נתקעתם

קראו מחדש את דף המודול — דוגמאות הקוד שם פועלות על נתוני הקורס
שאלו את ה-AI להסביר לכם את הודעת השגיאה
גגלו את השגיאה — ב-Stack Overflow יש פתרונות לכמעט כל שגיאת Python
פרסמו בפורום הקורס — כללו את הודעת השגיאה וצילום מסך של התאים הרלוונטיים
בואו לשעות קבלה

קריאה נוספת מומלצת (לסקרנים)

Claude, J. (2008). Morphometrics with R. Springer. [Most accessible R-based GM textbook]
Adams, D.C. et al. (2013). geomorph: An R package for the collection and analysis of geometric morphometric shape data. Methods in Ecology and Evolution 4(4):393–399.
Wilczek, J. (2015). Applying Geometric Morphometrics to Study Protohistoric European Metal Objects. [Thesis, provides thorough coverage of the flanged axe problem]
Rohlf, F.J. & Slice, D.E. (1990). Extensions of the Procrustes method for the optimal superimposition of landmarks. Systematic Biology 39(1):40–59. [The original GPA paper]

--- title: "משאבים" subtitle: "כלים, קריאות, מאגרי נתונים וקישורים שימושיים" lang: he dir: rtl --- ## כלים חיוניים ### כלים לכל מפגש (מבוססי דפדפן) | כלי | מה הוא עושה | קישור | |-----|------------|-------| | **Google Colab** | הרצת קוד Python בדפדפן | [colab.research.google.com](https://colab.research.google.com) | | **Claude** | AI ליצירת קוד והסבר | [claude.ai](https://claude.ai) | | **ChatGPT** | AI חלופי לקוד | [chat.openai.com](https://chat.openai.com) | | **Google Drive** | שמירת נתונים ומחברות | [drive.google.com](https://drive.google.com) | ### הורדה חד-פעמית (שבוע 3 בלבד) | כלי | מה הוא עושה | קישור | |-----|------------|-------| | **FIJI / ImageJ** | דיגיטיזציה של ציוני דרך מתמונות | [fiji.sc](https://fiji.sc) | --- ## חבילות Python כולן מותקנות ב-Colab עם `!pip install`: | חבילה | מטרה | תיעוד | |-------|-------|--------| | `morphops` | יישור פרוקרוסטס, splinesלוחות דקים | [github.com/tpgillam/morphops](https://github.com/tpgillam/morphops) | | `pyefd` | מתארים פורייה אליפטיים | [github.com/hbldh/pyefd](https://github.com/hbldh/pyefd) | | `scikit-learn` | PCA וכלי ML אחרים | [scikit-learn.org](https://scikit-learn.org) | | `scikit-image` | עיבוד תמונה (חילוץ קו מתאר) | [scikit-image.org](https://scikit-image.org) | | `matplotlib` | ציור גרפים | [matplotlib.org](https://matplotlib.org) | | `seaborn` | ויזואליזציה סטטיסטית | [seaborn.pydata.org](https://seaborn.pydata.org) | | `numpy` | מערכים מספריים | [numpy.org](https://numpy.org) | | `pandas` | טבלאות נתונים | [pandas.pydata.org](https://pandas.pydata.org) | | `statsmodels` | בדיקות סטטיסטיות | [statsmodels.org](https://www.statsmodels.org) | --- ## קריאות ### טקסטים יסודיים (מסופקים כקטעים) ::: {.ltr-block} - Kendall, D.G. (1977). The diffusion of shape. *Advances in Applied Probability* 9:428–430. - Bookstein, F.L. (1991). *Morphometric Tools for Landmark Data*, Chapter 2. Cambridge University Press. - Slice, D.E. (2007). Geometric morphometrics. *Annual Review of Anthropology* 36:261–281. - Zelditch, M.L. et al. (2012). *Geometric Morphometrics for Biologists* (2nd ed.), Chapter 1. Academic Press. ::: ### יישומים ארכאולוגיים מרכזיים ::: {.ltr-block} - Karasik, A. & Smilansky, U. (2011). Computerized morphological analysis of pottery. *Journal of Archaeological Science* 38(10):2644–2657. - Wilczek, J. et al. (2014). Morphometrics of Second Iron Age ceramics — strengths, weaknesses, and comparison with traditional typology. *Journal of Archaeological Science* 50:39–50. [**מאגר נתוני כלי החרס של הקורס**] - Monna, F. et al. (2013). Morphometry of Middle Bronze Age palstaves. *Journal of Archaeological Science* 40:507–516. [**רקע למאגר נתוני הגרזנים של הקורס**] - Wilczek, J. et al. (2015). Unsupervised model-based clustering for typological classification of Middle Bronze Age flanged axes. *Journal of Archaeological Science: Reports* 2:523–532. [**מאגר נתוני הגרזנים של הקורס**] - Bonhomme, V. et al. (2014). Momocs: Outline analysis using R. *Journal of Statistical Software* 56(13):1–24. - Selden, R.Z. (2018). Ceramic morphological organisation in the Southern Caddo Area. *Journal of Cultural Heritage* 32:215–223. ::: ### על AI במחקר ובכתיבה - דף הקורס: "כיצד להשתמש ב-AI לניתוח נתונים" (מסופק בשבוע 4) --- ## משאבי נתונים פתוחים | מאגר | הכי מתאים ל | קישור | |------|------------|-------| | **Zenodo** | מאגרי נתונים מפורסמים עם DOI | [zenodo.org](https://zenodo.org) | | **OSF** | רישומים מוקדמים ונתוני שחזור | [osf.io](https://osf.io) | | **Figshare** | נתוני נספח מכתבי-עת | [figshare.com](https://figshare.com) | | **MorphoSource** | סריקות תלת-ממד של פרטים ביולוגיים וארכאולוגיים | [morphosource.org](https://morphosource.org) | | **tDAR** | ארכיון נתונים ארכאולוגי ספציפי | [tdar.org](https://core.tdar.org) | | **ADS (בריטניה)** | נתוני ארכאולוגיה בריטית | [archaeologydataservice.ac.uk](https://archaeologydataservice.ac.uk) | **טיפ לחיפוש מאגרי נתוני GM:** > ב-Zenodo: חפשו `"tps file" archaeology` או `"geometric morphometrics" landmarks archaeology` --- ## מאגרי מוזיאונים למטלה 1 | אוסף | כיסוי | קישור | |------|-------|-------| | British Museum | עולמי, מצוין למטבעות | [britishmuseum.org/collection](https://www.britishmuseum.org/collection) | | Metropolitan Museum | עולמי, חזק במזרח הקרוב | [metmuseum.org/art/collection](https://www.metmuseum.org/art/collection) | | Europeana | אוספים אירופאיים מאוחדים | [europeana.eu](https://www.europeana.eu) | | ARACHNE | מאגר ארכאולוגי גרמני | [arachne.uni-koeln.de](https://arachne.uni-koeln.de) | | American Numismatic Society | מטבעות | [numismatics.org](https://numismatics.org) | | Finds.org.uk | חפצי מתכת של רומן בריטניה | [finds.org.uk](https://finds.org.uk) | --- ## כיצד לכתוב פרומפטי AI טובים (מהדורה מהירה) השתמשו במסגרת **PEAR**: ``` P — Purpose: "אני רוצה להשוות שתי קבוצות של צורות מטבע..." E — Example: "הנתונים שלי נראים כך: [הדביקו 5 שורות ראשונות או צורת מערך]" A — Action: "כתבו קוד Python ש..." R — Result: "...ויפיק גרף פיזור מסומן עם מקרא" ``` **איטרציה היא נורמלית.** הקוד שנוצר ראשית על ידי AI עשוי לדרוש ניפוי באגים. הדביקו את הודעת השגיאה חזרה ל-AI ובקשו ממנו לתקן את הבעיה. --- ## אם נתקעתם 1. **קראו מחדש את דף המודול** — דוגמאות הקוד שם פועלות על נתוני הקורס 2. **שאלו את ה-AI** להסביר לכם את הודעת השגיאה 3. **גגלו את השגיאה** — ב-Stack Overflow יש פתרונות לכמעט כל שגיאת Python 4. **פרסמו בפורום הקורס** — כללו את הודעת השגיאה וצילום מסך של התאים הרלוונטיים 5. **בואו לשעות קבלה** --- ## קריאה נוספת מומלצת (לסקרנים) ::: {.ltr-block} - Claude, J. (2008). *Morphometrics with R*. Springer. [Most accessible R-based GM textbook] - Adams, D.C. et al. (2013). geomorph: An R package for the collection and analysis of geometric morphometric shape data. *Methods in Ecology and Evolution* 4(4):393–399. - Wilczek, J. (2015). *Applying Geometric Morphometrics to Study Protohistoric European Metal Objects*. [Thesis, provides thorough coverage of the flanged axe problem] - Rohlf, F.J. & Slice, D.E. (1990). Extensions of the Procrustes method for the optimal superimposition of landmarks. *Systematic Biology* 39(1):40–59. [The original GPA paper] :::